プロテオミクス研究の常識を覆すAB SCIEXの次世代プロテオミクスプラットフォーム

株式会社エービー・サイエックス
2014年6月16日

Press Release

TripleTOF® 6600 System with SWATH™ Acquisition 2.0はすべての測定において検出可能なタンパク質とペプチドの全情報を取得し、プロテオームへの深い洞察を提供します

Framingham - June 16, 2014
ASMS 2014 - メリーランド州ボルチモア

2014年6月16日 - ライフサイエンス分析テクノロジー分野の世界的リーダーであるAB SCIEXは、本日、定量プロテオミクスのための革新的ソリューションとなるTripleTOF® 6600 system with SWATH™ Acquisition 2.0を発表しました。新しいSWATH™ Acquisition 2.0と組み合わさったこの高分解能の精密質量システムは、高度なバイオマーカー探索とシステムバイオロジー研究に、プロテオームデータの難問に取り組むための新たな力をもたらします。プロテオミクス研究の最先端は網羅的な同定から包括的定量へと移行していることから、これまでのターゲット分析の「ゴールドスタンダード」であるMRMでしか達成することのできなかったレベルの定量精度及び再現性とデータの完全性のレベルで、大きなサンプルセットにわたり数千ものタンパク質の網羅的定量を可能にするAB SCIEXソリューションは、独特な地位を獲得しています。

AB Sciex社長のRainer Blairは、「TripleTOF 6600 system with SWATH 2.0は高度なデータ完全性と定量精度を提供することにより、プロテオミクス研究を本質的に変容させます。この新しいプラットフォームはバイオマーカーと疾患経路研究に関してより大きな洞察を獲得する力を研究者に与え、これが病気の早期発見と、いずれはオーダーメイド治療にもつながります。」と語りました。

AB SCIEX SWATH Acquisitionはデータ非依存式MS/MS取得を採用しており、サンプル中の検出可能なペプチドのすべてをフラグメント化することにより定量的MS/MSデータを取得する技術は、プロテオミクス界の包括的データに対する関心を再燃させました。このアプローチは、ターゲットプロテオミクス測定のキャパシティを30倍以上に増やし、測定時間を90%も短縮することが示されています。今や研究者らは、TripleTOF 6600システムの拡大したダイナミックレンジにより、複雑なサンプルをより深く調べることができるようになっています。革新的なQ1ウインドウ幅を可変させたデータ取得およびSWATH 2.0データ解析ソフトウェアとの組み合わせにより、定量結果の著しい改善も実現しています。

スイス連邦工科大学(ETH)チューリッヒ校、分子生物学研究所教授のRuedi Aebersold, Ph.D.は、「SWATHは、バイオマーカー探索および大規模定量ワークフローとして、その多大な価値がすでに証明されています。Q1ウインドウ幅可変SWATH取得とTripleTOF 6600の拡大したダイナミックレンジの組み合わせは、それぞれのサンプルについて、これまで達成されたことのない生物学的洞察につながる可能性がある、より正確で完全な知識を生物学研究者に与えてくれます。」とコメントしています。

TripleTOF 6600 System with SWATH 2.0と他のシステムを比較した初期の実験では、CV値20パーセント未満(LC/MSデータの良好な定量限界の指標として用いられる閾値)で90%以上のペプチドを定量できることが実証されました。このようなキャパシティとデータ完全性の進歩は、ゲノミクスやトランスクリプトミクスなどの大規模な生物学実験との統合にさらに近づきやすくしてくれることが期待されます。

シーダーズ-サイナイ医療センターの高度臨床生物系研究所所長、シーダーズ-サイナイ心臓研究所のバーブラ・ストライサンド女性心臓センター長およびWomen's Heart HealthのErika J. Glazer議長職を務めるJennifer Van Eyk, Ph.D.は、「トランスレーショナル研究でプロテオミクスの可能性をフル活用するためには、1回の測定で何千ものタンパク質を正確に定量する必要があります。TripleTOFとSWATHのシステムは、初めてこれを行うのを可能にし、私の研究目的の推進に貢献してくれています。」と語りました。

■AB SCIEXについて
AB SCIEXは、科学者とラボ分析者が自分たちの分野の限界を打ち破り、直面している複雑な分析上の難問に対処できるようにすることにより、私たちが暮らす世界が発展するのをお手伝いしています。液体クロマトグラフィー-質量分析業界における世界的リーダーシップおよび世界クラスのサービスとサポートにより、AB SCIEXは、基礎研究、創薬および医薬品開発、食品および環境検査、法医学ならびに臨床研究に取り組む世界中の何千人もの科学者とラボ分析者から信頼されるパートナーとなっています。25年以上の技術革新の実績を持つAB SCIEXは、お客様の進化し続けるニーズに耳を傾けて理解することにより、ルーチン分析と複雑分析で達成できることを刷新し続ける、信頼できる敏感で直感的なソリューションの開発に秀でています。詳しくはwww.absciex.com.をご覧下さい。

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